工具库

共收录 110 个免费/开源科研工具

InkscapeGPL-2.0

专业级矢量图形编辑器,论文配图制作首选免费替代方案。

论文绘图
开源
QGISGPL-2.0

功能最强大的开源 GIS 桌面软件,支持几乎所有地理数据格式。

GIS / 空间分析遥感 / 地理数据
开源11.0k
R / RStudioGPL-2.0

统计计算与数据可视化的学术标准,ggplot2 图表广泛见于顶刊。

统计分析论文绘图
开源
Python(科研栈)PSF-2.0

NumPy / Matplotlib / SciPy / Pandas 覆盖科研数据处理全场景。

统计分析论文绘图
开源63.0k
SNAP(ESA Sentinel)GPL-3.0

欧空局官方遥感处理软件,专为 Sentinel 系列卫星数据设计。

遥感 / 地理数据
开源340
SAGA GISGPL-2.0

地形分析和地貌学研究的专业工具,DTM/DEM 分析首选。

GIS / 空间分析
开源480
JamoviAGPL-3.0

界面友好的统计分析软件,SPSS 的最佳免费替代方案。

统计分析
开源1.1k
ImageJ / FijiGPL-2.0

生命科学图像分析的行业标准,支持几乎所有显微镜图像格式。

图像分析
开源980
APSIM非商业免费

全球领先的农业系统模型,支持作物、土壤、水分全过程模拟。

作物模型
免费430
DSSAT非商业免费

作物模型决策支持系统,涵盖 40+ 种作物的生长模拟模型。

作物模型
免费190
ZoteroAGPL-3.0

最强大的免费文献管理软件,支持一键抓取、多端同步、Word 插件。

文献管理
开源10.0k
PDFsam BasicAGPL-3.0

PDF 分割、合并、旋转、提取页面,免费且无广告。

PDF / 文档处理
开源3.1k
APSIM Simulation Toolkit自研MIT

【自研】APSIM Pipeline GUI Pro v5.5.40,图形界面批量运行 APSIM 模型,支持参数扫描与情景对比,开箱即用。

作物模型
开源
PDF Watermark Tool自研MIT

【自研】PDF Watermark Tool v5.0.0,批量为 PDF 添加自定义水印,支持文字/图片水印,可设置透明度和位置。

PDF / 文档处理
开源
VBA Certificate Generator自研MIT

【自研】Windows GUI 工具,为 Excel / Word VBA 宏项目生成自签名代码签名证书。

Excel / 表格工具
开源
RAWGraphsApache-2.0

面向非编程用户的免费开源数据可视化工具,适合制作复杂图表草图。

论文绘图数据可视化
开源
Datawrapper免费增值

在线制作清晰图表和地图的工具,适合快速生成可分享的数据图。

数据可视化
免费
GRASS GISGPL

强大的开源地理空间处理引擎,适合大规模 GIS、遥感和地形分析。

GIS / 空间分析遥感 / 地理数据
开源
MapshaperMPL-2.0

轻量级矢量地图处理工具,适合 Shapefile/GeoJSON 简化、转换和清理。

GIS / 空间分析
开源
Orfeo ToolBoxApache-2.0

开源遥感影像处理工具箱,支持大影像处理、分类、分割和特征提取。

遥感 / 地理数据图像分析
开源
Google Earth Engine研究免费/平台服务

云端遥感与地理空间分析平台,适合大尺度遥感数据处理。

遥感 / 地理数据GIS / 空间分析
免费
JASPAGPL-3.0

免费开源的图形界面统计软件,支持经典统计和贝叶斯统计。

统计分析
开源
GNU PSPPGPL-3.0

GNU 出品的免费统计软件,适合 SPSS 数据和基础统计分析。

统计分析
开源
QuPathGPL-3.0

开源数字病理和生物图像分析软件,适合大幅组织切片图像。

图像分析
开源
ilastikGPL-2.0

交互式机器学习图像分割工具,适合非编程用户进行像素分类。

图像分析机器学习
开源
AquaCrop免费

FAO 作物水分生产力模型,适合水分胁迫和灌溉管理研究。

作物模型
免费
WOFOST开源生态实现

经典作物生长模拟模型,常用于产量潜力和气候影响研究。

作物模型
开源
JabRefMIT

面向 BibTeX / LaTeX 用户的免费开源文献管理工具。

文献管理
开源
Stirling PDFMIT

开源 PDF 工具平台,支持合并、转换、压缩、OCR、加密等多种操作。

PDF / 文档处理
开源
LibreOfficeMPL-2.0

免费开源办公套件,适合文档、表格、演示和基础数据整理。

Excel / 表格工具
开源
GIMPGPL

免费开源图像编辑软件,适合论文图片后期处理和位图编辑。

论文绘图图像分析
开源
KritaGPL-3.0

免费开源绘图软件,适合科研示意图、手绘图和图像标注。

论文绘图
开源
Orange Data MiningGPL-3.0

可视化机器学习和数据挖掘工具,适合不写代码完成探索分析。

数据可视化机器学习
开源
GephiGPL/CDDL

免费开源网络可视化软件,适合复杂关系网络和共现网络分析。

数据可视化
开源
CytoscapeLGPL

开源复杂网络可视化平台,常用于生物网络和系统生物学分析。

数据可视化
开源
OpenRefineBSD-3-Clause

免费开源数据清洗工具,适合整理混乱表格和批量标准化文本。

Excel / 表格工具
开源
OpenDroneMapAGPL-3.0

开源无人机影像处理工具,可生成正射影像、点云、DEM 和三维模型。

点云 / 三维遥感 / 地理数据
开源
WhiteboxTools开源/免费工具集

开源地理空间分析工具箱,适合地形、水文、LiDAR 和栅格分析。

GIS / 空间分析遥感 / 地理数据
开源
Mendeley Reference Manager免费软件

免费的文献管理软件,适合文献整理、PDF 管理和引用插入。

文献管理
免费
Obsidian个人免费/商业授权

本地 Markdown 知识库工具,适合科研笔记、项目管理和长期知识积累。

文献管理论文写作
免费
ZettlrGPL-3.0

免费开源 Markdown 学术写作工具,适合论文草稿和文献笔记。

论文写作文献管理
开源
ONLYOFFICEAGPL-3.0/免费桌面版

免费桌面办公套件和开源协作文档方案,兼容 Word、Excel、PowerPoint。

Excel / 表格工具科研协作
开源
OCRmyPDFMPL-2.0

开源命令行工具,可为扫描版 PDF 添加可搜索 OCR 文本层。

PDF / 文档处理
开源
Tesseract OCRApache-2.0

开源 OCR 识别引擎,支持多语言文本识别和命令行调用。

图像分析PDF / 文档处理
开源
GDALMIT

GIS 与遥感数据处理的底层基础库,支持大量栅格和矢量格式读写与转换。

GIS / 空间分析遥感 / 地理数据
开源
CloudCompareGPL

开源三维点云处理软件,适合 LiDAR 点云、森林结构和三维场景分析。

点云 / 三维
开源
FORCEGPL-3.0

面向 Landsat / Sentinel-2 长时序分析的开源遥感处理框架。

遥感 / 地理数据
开源
napariBSD-3-Clause

Python 生态中的开源多维科学图像查看、标注和分析工具。

图像分析
开源
CellProfilerBSD-3-Clause

Broad Institute 出品的免费开源图像分析软件,适合细胞图像高通量分析。

图像分析
开源
TeXstudioGPL-2.0

免费开源 LaTeX 编辑器,适合论文、学位论文和公式密集型文档写作。

论文写作
开源
PandocGPL

开源文档格式转换工具,可在 Markdown、Word、LaTeX、HTML 等格式之间转换。

论文写作
开源
PAST免费软件(未确认开源许可证)

免费的科学统计分析软件,常用于生态学、古生物学和多元统计分析。

统计分析
免费
Stan / RStanStan: BSD-3-Clause;RStan: GPL-3.0

开源贝叶斯统计建模工具,适合层级模型、MCMC 和复杂统计模型。

统计分析
开源
ParaViewBSD-3-Clause

开源三维科学数据可视化软件,适合数值模拟、流场和三维结果展示。

数值模拟数据可视化
开源
NetLogoGPL-2.0-or-later

开源主体建模平台,适合生态系统、种群动态和复杂系统模拟。

生态 / 环境模型
开源
SWAT+开源(以官方仓库许可证为准)

开源流域水文与水质模型,适合径流、侵蚀、养分循环和流域管理研究。

水文 / 地下水模型
开源
GeoDaGPL-3.0

免费开源空间数据分析软件,适合空间自相关、LISA 和空间回归入门。

GIS / 空间分析统计分析
开源
OpenJUMPGPL-2.0

轻量级开源桌面 GIS,适合查看、编辑和分析矢量空间数据。

GIS / 空间分析
开源
gvSIG DesktopGPL

开源桌面 GIS 软件,支持常用栅格、矢量和网络地图服务。

GIS / 空间分析
开源
RStudio IDEAGPL-3.0

免费开源 R 语言集成开发环境,科研统计分析和 R Markdown 写作常用。

统计分析论文绘图
开源
JuliaMIT

高性能开源科学计算语言,适合数值模拟、优化和大规模计算。

统计分析数值模拟
开源
GNU OctaveGPL-3.0-or-later

MATLAB 风格的免费开源数值计算环境,适合教学和算法验证。

统计分析数值模拟
开源
ScilabGPL-2.0

免费开源科学计算软件,适合数值计算、系统仿真和工程教学。

统计分析数值模拟
开源
MaximaGPL

免费开源计算机代数系统,适合符号计算、公式推导和数学建模。

统计分析
开源
BlenderGPL

免费开源三维创作软件,适合三维建模、科学可视化和场景渲染。

数据可视化数值模拟
开源
MeshLabGPL

开源三维网格处理软件,适合点云、网格清理和三维模型后处理。

点云 / 三维
开源
3D SlicerBSD-style

免费开源医学与三维图像分析平台,适合体数据分割和可视化。

图像分析
开源
OMEROAGPL-3.0

开源显微图像数据管理平台,适合大规模生物图像存储、浏览和共享。

图像分析
开源
BioImage Suite WebApache-2.0

开源网页版生物与医学图像分析工具,适合图像配准、分割和可视化。

图像分析
开源
KNIME Analytics PlatformGPL-3.0 with exception

免费开源可视化数据分析平台,适合拖拽式数据处理、建模和自动化流程。

数据可视化机器学习
开源
WekaGPL-3.0

经典免费开源机器学习 GUI 工具,适合教学、分类、聚类和模型比较。

机器学习
开源
MLflowApache-2.0

开源机器学习实验管理平台,适合记录模型训练、参数、指标和模型版本。

机器学习
开源
DVCApache-2.0

开源数据与模型版本管理工具,适合科研数据、模型和实验文件追踪。

机器学习
开源
GitGPL-2.0

免费开源版本控制系统,是代码、脚本和论文项目协作的基础工具。

科研协作
开源
GitHub DesktopMIT

免费开源图形界面 Git 工具,适合非程序员管理 GitHub 项目。

科研协作
开源
FreeCADLGPL-2.1

免费开源参数化 CAD 软件,适合实验装置、结构件和工程示意图建模。

数值模拟
开源
KiCadGPL-3.0-or-later

免费开源电子设计自动化软件,适合电路原理图和 PCB 绘制。

数值模拟
开源
OpenFOAMGPL-3.0

免费开源 CFD 工具箱,适合流体力学、传热和多相流数值模拟。

数值模拟
开源
Elmer FEMGPL-2.0-or-later

开源多物理场有限元软件,适合结构、流体、传热和电磁模拟。

数值模拟
开源
Code_AsterGPL

开源结构力学有限元求解器,适合线性、非线性和热-力耦合分析。

数值模拟
开源
MOOSE FrameworkLGPL-2.1

开源多物理场有限元框架,适合开发复杂耦合模拟程序。

数值模拟
开源
Eclipse SUMOEPL-2.0

免费开源交通流模拟软件,适合城市道路、公共交通和多模式出行模拟。

数值模拟
开源
GAMA PlatformGPL-3.0

开源多主体建模平台,适合空间显式生态、城市和复杂系统模拟。

生态 / 环境模型
开源
Repast SimphonyBSD-style

开源主体建模与仿真平台,适合社会、生态和复杂系统模拟。

生态 / 环境模型
开源
OpenModelicaOSMC-PL / AGPL option

开源 Modelica 建模与仿真环境,适合复杂系统动力学建模。

数值模拟
开源
DWSIMGPL/LGPL

开源化工流程模拟软件,适合稳态、动态流程和热力学计算。

数值模拟
开源
openLCAMPL-2.0

免费开源生命周期评价软件,适合 LCA、碳足迹和环境影响评估。

生态 / 环境模型
开源
BrightwayBSD-3-Clause

开源 Python 生命周期评价框架,适合可重复的 LCA 编程分析。

生态 / 环境模型
开源
Epi InfoPublic Domain / Open Source

CDC 出品的公共领域公共卫生统计工具,适合流行病学调查和数据分析。

统计分析问卷 / 野外调查
开源
DHIS2BSD-3-Clause

开源健康数据管理平台,适合公共卫生数据采集、分析和可视化。

数据可视化问卷 / 野外调查
开源
KoboToolboxOpen source; components vary

开源野外数据采集平台,适合问卷、移动端表单和离线调查。

问卷 / 野外调查
开源
ODKApache-2.0

开源移动端数据采集工具集,适合离线问卷、野外调查和表单管理。

问卷 / 野外调查
开源
LimeSurveyGPL-2.0-or-later

开源在线问卷系统,适合自托管问卷、调查和教学评估。

问卷 / 野外调查
开源
TaguetteAGPL-3.0

免费开源质性研究文本编码工具,适合访谈、开放题和文档标注。

质性分析
开源
QualCoderLGPL-3.0

开源质性数据分析软件,适合文本、图片、音频和视频资料编码。

质性分析
开源
PCSE / WOFOSTEUPL-1.1-or-later

开源 Python 作物模拟框架,包含 WOFOST 等作物模型实现。

作物模型
开源
MONICAMPL-2.0

开源农田生态系统模型,模拟作物、土壤水分、碳氮循环和管理措施影响。

作物模型
开源
VIC ModelMIT

开源大尺度水文模型,适合陆面水文过程、径流和能量平衡模拟。

水文 / 地下水模型
开源
MODFLOWPublic Domain

USGS 公共领域地下水模型,适合地下水流、含水层和地表水-地下水耦合模拟。

水文 / 地下水模型
开源
InVESTBSD-style

开源生态系统服务评估模型,适合土地利用变化和自然资本分析。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
MarxanOpen source; check release license

免费开源保护规划工具,适合自然保护地优先区和空间规划分析。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
CircuitscapeMIT

开源景观连通性模型,基于电路理论模拟物种迁移和基因流。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
Linkage MapperGPL-3.0

开源栖息地廊道分析工具箱,适合野生动物连通性和最小成本路径分析。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
MaxEntMIT

开源物种分布模型软件,适合存在点数据的生态位和栖息地适宜性建模。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
WallaceGPL-3.0

开源 R Shiny 物种分布建模平台,适合可重复生态位模型流程。

生态 / 环境模型GIS / 空间分析
开源
biomod2GPL-3.0

开源 R 物种分布建模包,支持多算法建模、集合预测和模型评价。

生态 / 环境模型统计分析
开源
ENMevalGPL-3.0

开源 R 包,用于 MaxEnt / 生态位模型参数调优和空间交叉验证。

生态 / 环境模型统计分析
开源
veganGPL-2.0

开源 R 群落生态统计包,支持 NMDS、CCA、RDA、多样性和群落分析。

统计分析生态 / 环境模型
开源
ade4 / adespatialGPL-2.0 / GPL-3.0

开源 R 生态多元统计与空间生态分析包,适合排序、空间结构和多尺度分析。

统计分析生态 / 环境模型
开源
lme4 / glmmTMBGPL-2.0/GPL-3.0; AGPL-3.0

开源 R 混合效应模型工具,适合层级数据、重复测量和零膨胀模型。

统计分析
开源
工具库 | ZIRULAB