图像分析中级
科研图像分析流程
面向显微图像、病害图像、颗粒图像和组织切片的分割、计数、测量与统计流程。
预计耗时：2-5 小时 5 个步骤
操作步骤
1
图像整理与备份
文件管理 / GIMP统一图像命名、格式、分辨率和实验分组，保留原始图像备份。
原始图像不要覆盖，所有处理结果应另存到新文件夹。
2
预处理
ImageJ / Fiji进行裁剪、尺度校准、背景扣除、通道分离和亮度对比度检查。
不同组别图像应使用一致的预处理参数。
3
分割与识别
ilastik / QuPath / ImageJ根据图像类型选择阈值分割、机器学习分割或对象检测方法。
分割结果要人工抽查，不能只相信自动输出。
4
测量与导出
ImageJ / QuPath导出面积、数量、长度、灰度、荧光强度或病斑比例等指标。
导出表格要保留图像 ID 和实验分组，方便统计分析。
5
统计与绘图
Python / R对图像指标进行统计检验和可视化，形成论文结果图。
注意样本独立性：同一张图内多个对象不一定等于多个独立重复。
流程完成